La Secretaría de Gobierno Municipal se rige por los siguientes objetivos:

• Mejorar continuamente la eficacia, eficiencia y efectividad del Sistema Integrado de Gestión.
• Garantizar la eficiencia en la prestación de los servicios a la comunidad.
• Cumplir  de manera  eficaz y oportuna con la Planeación Estratégica, definida en la Alcaldía de Popayán
• Contar con el apoyo humano competente, logística y tecnología, necesarias para lograr el cumplimiento de la misión.
• Fortalecer el cumplimiento de los fines esenciales del Estado.
• Garantizar el cumplimiento de las actividades esenciales de los Procesos Misionales de la Alcaldía de Popayán.
• Incrementar la participación de la comunidad en la evaluación de los proyectos que deben ejecutar los Procesos de la Alcaldía de Popayán.